قال الرئيس التركي رجب طيب أردوغان إن الطريقة التي تتعامل بها الحكومة المصرية مع جماعة الإخوان المسلمين، تختلف عن طريقة تعامل الحكومة التركية مع أعضاء جماعة فتح الله غولن "لأن التطورات كانت مختلفة"ن بحسب تعبير أردوغان. وقال أردوغان في حوار مع قناة "روتانا خليجية" متحدثا عن الرئيس المصري عبد الفتاح السيسي – إن "هذا الشخص الموجود حاليا على رأس الدولة كان وزيرا للدفاع لمرسي… تصوروا أن وزير الدفاع يأتي وينقلب على رأس الدولة"، مضيفا أنه في حالة الإفراج عن الرئيس مرسي وأفراد جماعته فلن يكون هناك مشكلة في تطبيع العلاقات مع مصر. ووصف الرئيس التركي الانتخابات الرئاسية التي تمت بعد عزل محمد مرسي بأنها "صورية"، مشيرا إلى أنه عندما وصل إلى إسطنبول بعد محاولة الانقلاب عليه وجد الآلاف من الشعب بانتظاره. جدير بالذكر، أن العلاقة بين القاهرة وأنقرة توترت بعد عزل الجيش لجماعة الإخوان المسلمين في يوليو 2013. وشهدت الفترة الأخيرة عدة تصريحات من رئيس الوزراء التركي بن علي يلدريم حول النية لإعادة العلاقات مع مصر إلا أن كلا الدولتين لم تتخذا أي خطوات في هذا الاتجاه.