أفاد تصنيف تايمز للتعليم العالي في نسخته الأخيرة (2021) أن جامعة سيدي محمد بن عبد الله أبانت عن تميزها في العديد من التخصصات. ففي العلوم السريرية والصحية، تتمركز جامعة فاس في الفئة 400-301 على الصعيد الدولي، ضمن أوائل الجامعات المغربية. وسجلت الاحالات العلمية للأشغال المنجزة في الجامعة نقطة تفوق 65. وفي المجال المعلوماتي، تتموقع الجامعة ضمن الفئة 800-601، وهي الأولى وطنيا في هذا المجال. كما صنفت الجامعة ضمن الفئة 800-601 في مجال علوم الهندسة وفي فئة 1000 فما فوق بالنسبة للعلوم الفيزيائية. وترى الجامعة أن المؤشرات الانتاجية العلمية في مختلف المجالات تعكس اختياراتها المتجهة نحو الأداء والجودة خصوصا بعد تأهيل مختبراتها وقرارات مجلس الجامعة الأخيرة فيما يتصل بالبحث والابتكار. وتتوقع أن يكون لتفعيل التدابير المحفزة على البحث العلمي والانفتاح الدولي للاساتذة الباحثين والالتزام بنشر مقالين مفهرسين على الأقل قبل تقديم أي أطروحة مفعول واعد بالنسبة لمستقبل البحث والابتكار في الجامعة.